Ricardo Wurmus 272cb5a23f gnu: r-rsamtools: Update to 2.0.1. ... * gnu/packages/bioinformatics.scm (r-rsamtools): Update to 2.0.1.		2019-09-28 12:24:15 +02:00
..
aux-files	gnu: linux-libre: Enable all nftables families.	2019-09-18 19:04:59 +08:00
bootstrap	…
patches	gnu: dealii: Update to 9.1.1.	2019-09-27 22:23:44 -05:00
abduco.scm	…
abiword.scm	…
accessibility.scm	…
acct.scm	…
acl.scm	…
ada.scm	…
admin.scm	gnu: Add debops.	2019-09-26 17:18:23 +02:00
adns.scm	…
agda.scm	gnu: Move non-compilers out of haskell.scm.	2019-08-31 09:25:49 -04:00
aidc.scm	…
algebra.scm	gnu: xtensor: Use HTTPS home page.	2019-09-28 05:36:12 +02:00
android.scm	gnu: enjarify: Adjust native-inputs.	2019-09-20 23:11:46 -07:00
animation.scm	…
anthy.scm	…
antivirus.scm	…
apl.scm	…
apr.scm	…
arcan.scm	…
aspell.scm	…
assembly.scm	…
astronomy.scm	…
attr.scm	…
audio.scm	gnu: vco-plugins: Fix typo.	2019-09-23 13:01:43 -07:00
augeas.scm	…
authentication.scm	gnu: Add yubico-pam.	2019-09-15 09:28:24 +02:00
autogen.scm	…
autotools.scm	…
avahi.scm	…
avr.scm	…
axoloti.scm	…
backup.scm	…
base.scm	gnu: glibc-utf8-locales: Fix cross-compilation.	2019-09-04 18:05:59 +02:00
bash.scm	…
batik.scm	…
bdw-gc.scm	…
benchmark.scm	…
bioconductor.scm	gnu: Add r-variancepartition.	2019-09-15 22:57:47 +02:00
bioinformatics.scm	gnu: r-rsamtools: Update to 2.0.1.	2019-09-28 12:24:15 +02:00
bison.scm	…
bittorrent.scm	gnu: rtorrent: Update to 0.9.8.	2019-08-29 14:44:21 +02:00
boost.scm	…
bootloaders.scm	gnu: dtc: Update to 1.5.1.	2019-09-26 06:28:23 +02:00
bootstrap.scm	…
build-tools.scm	…
busybox.scm	…
c.scm	…
calcurse.scm	…
calendar.scm	…
ccache.scm	…
cdrom.scm	gnu: cdemu-client: Update to 3.2.3.	2019-09-01 18:27:02 +02:00
cedille.scm	gnu: cedille: Adjust import list.	2019-09-01 00:13:28 +02:00
certs.scm	…
check.scm	gnu: umockdev: Update to 0.13.2.	2019-09-11 00:33:50 +02:00
chemistry.scm	…
chez.scm	…
chromium.scm	gnu: ungoogled-chromium: Update to 76.0.3809.132-0.8eba5c0.	2019-08-29 14:44:22 +02:00
ci.scm	gnu: cuirass: Update to d27ff21.	2019-09-23 23:41:19 +02:00
cinnamon.scm	…
clojure.scm	…
cluster.scm	gnu: keepalived: Update home page.	2019-09-24 20:12:55 +02:00
cmake.scm	gnu: cmake: Add package variant that knows about X.509 certificates.	2019-09-11 00:09:39 +02:00
cobol.scm	…
code.scm	…
commencement.scm	gnu: glibc-utf8-locales: Fix cross-compilation.	2019-09-04 18:05:59 +02:00
compression.scm	gnu: Add makeself-safeextract.	2019-09-27 09:53:55 +02:00
compton.scm	…
conky.scm	gnu: conky: Update to 1.11.5.	2019-08-30 03:40:32 +02:00
connman.scm	…
cook.scm	…
coq.scm	…
cpio.scm	…
cpp.scm	gnu: xtl: Update to 0.6.7.	2019-09-28 05:36:12 +02:00
cppi.scm	…
cran.scm	gnu: r-assertable: Update to 0.2.7.	2019-09-28 12:24:14 +02:00
crates-io.scm	gnu: rust-widestring: Fix typo.	2019-09-23 13:01:41 -07:00
cross-base.scm	…
crypto.scm	…
cryptsetup.scm	…
cups.scm	gnu: foo2zjs: Update to 20190909.	2019-09-11 16:30:15 +02:00
curl.scm	…
cvassistant.scm	…
cyrus-sasl.scm	…
databases.scm	gnu: tdb: Update to 1.4.2.	2019-09-05 00:21:42 +02:00
datamash.scm	gnu: datamash: Update to 1.5.	2019-09-23 09:38:50 +03:00
datastructures.scm	…
dav.scm	…
dbm.scm	…
dc.scm	…
debian.scm	…
debug.scm	…
dejagnu.scm	…
dico.scm	…
dictionaries.scm	gnu: grammalecte: Update to 1.4.0.	2019-09-09 22:19:01 +02:00
diffoscope.scm	gnu: diffoscope: Adjust native-inputs for architecture limitations.	2019-09-21 15:35:53 -07:00
digest.scm	…
direct-connect.scm	…
disk.scm	gnu: f3: Update to 7.2.	2019-09-26 05:24:31 +02:00
display-managers.scm	…
distributed.scm	gnu: Add boinc-client and boinc-server.	2019-09-24 08:53:17 +02:00
django.scm	…
djvu.scm	…
dlang.scm	…
dns.scm	gnu: bind: Update to 9.14.6 [fixes CVE-2019-6471].	2019-09-18 23:59:29 +02:00
docbook.scm	…
docker.scm	gnu: docker: Add support for tini.	2019-09-05 09:38:23 +09:00
documentation.scm	…
dunst.scm	…
dvtm.scm	…
easyrpg.scm	…
ebook.scm	…
ed.scm	…
education.scm	gnu: education.scm: Import (gnu packages curl).	2019-09-16 16:16:18 +03:00
efi.scm	…
electronics.scm	…
elf.scm	…
elixir.scm	gnu: elixir: Don't use unstable tarball.	2019-09-17 16:04:43 +02:00
elm.scm	…
emacs-xyz.scm	gnu: Add emacs-skeletor.	2019-09-27 23:00:46 +02:00
emacs.scm	gnu: emacs: Update to 26.3.	2019-08-30 03:40:33 +02:00
embedded.scm	gnu: python-libmpsse: Update to 1.4.	2019-09-26 15:58:48 +02:00
emulators.scm	gnu: retroarch: Update to 1.7.8.4.	2019-09-16 08:25:04 +02:00
enchant.scm	gnu: enchant: Update to 2.2.7.	2019-09-23 17:58:32 +02:00
engineering.scm	gnu: Add freecad.	2019-09-22 08:58:20 +02:00
enlightenment.scm	gnu: efl: Update to 1.22.5.	2019-09-19 14:35:31 +03:00
entr.scm	…
erlang.scm	…
fabric-management.scm	…
fcitx.scm	…
figlet.scm	…
file-systems.scm	…
file.scm	…
finance.scm	gnu: monero-gui: Update to 0.14.1.2.	2019-09-10 00:34:41 +02:00
firmware.scm	…
flashing-tools.scm	…
flex.scm	…
fltk.scm	…
fonts.scm	…
fontutils.scm	…
forth.scm	…
fpga.scm	…
freedesktop.scm	gnu: libmbim: Update to 1.20.0.	2019-09-09 23:17:51 +02:00
freeipmi.scm	…
fribidi.scm	…
ftp.scm	…
fvwm.scm	…
game-development.scm	gnu: Move openmw-openscenegraph to graphics.scm.	2019-09-24 23:51:48 +02:00
games.scm	gnu: gnujump: Add desktop file.	2019-09-13 17:07:16 +03:00
gawk.scm	…
gcal.scm	…
gcc.scm	…
gd.scm	…
gdb.scm	gnu: gdb-8.3: Update to 8.3.1.	2019-09-23 10:05:59 +03:00
genealogy.scm	…
genimage.scm	…
geo.scm	gnu: xygrib: Update to 1.2.6.1.	2019-09-27 12:28:43 +02:00
gettext.scm	…
ghostscript.scm	gnu: ghostscript: Keep the replacement private.	2019-09-04 23:41:07 +02:00
gimp.scm	…
gkrellm.scm	…
gl.scm	gnu: Add mojoshader-with-viewport-flip.	2019-09-24 11:32:54 +02:00
glib.scm	gnu: Add xdg-dbus-proxy.	2019-09-27 18:57:37 +02:00
gnome.scm	gnu: WebKitGTK: Update to 2.26.1.	2019-09-27 18:57:37 +02:00
gnu-doc.scm	…
gnu-pw-mgr.scm	…
gnucash.scm	gnu: aqbanking: Update to 5.8.1.	2019-08-30 03:41:43 +02:00
gnunet.scm	…
gnupg.scm	gnu: guile-gcrypt: Update to 0.2.0.	2019-09-11 14:08:33 +02:00
gnustep.scm	…
gnuzilla.scm	gnu: icecat: Update to 60.9.0-guix1.	2019-09-02 21:02:48 -04:00
gobby.scm	…
golang.scm	gnu: Add go-github-com-shirou-gopsutil.	2019-09-05 11:09:36 -04:00
gperf.scm	…
gpodder.scm	…
gprolog.scm	…
gps.scm	gnu: gama: Update to 2.07.	2019-09-05 14:46:42 +03:00
graph.scm	gnu: r-diffusionmap: Update to 1.2.0.	2019-09-14 00:37:46 +02:00
graphics.scm	gnu: Move openmw-openscenegraph to graphics.scm.	2019-09-24 23:51:48 +02:00
graphviz.scm	…
groff.scm	…
groovy.scm	…
gsasl.scm	…
gstreamer.scm	gnu: OpenEXR: Update to 2.4.0 [fixes CVE-2018-18443, CVE-2018-18444].	2019-09-24 20:12:56 +02:00
gtk.scm	…
guile-wm.scm	gnu: guile-wm: Fix cross-compilation.	2019-09-04 18:01:49 +02:00
guile-xyz.scm	gnu: guile-parted: Update to 0.0.2.	2019-09-25 16:03:23 +02:00
guile.scm	gnu: guile-json: Use "mirror://savannah" URL.	2019-09-11 14:08:34 +02:00
gv.scm	…
gxmessage.scm	…
ham-radio.scm	…
hardware.scm	…
haskell-apps.scm	gnu: git-annex: Update to 7.20190912.	2019-09-16 10:27:36 +02:00
haskell-check.scm	gnu: Move non-compilers out of haskell.scm.	2019-08-31 09:25:49 -04:00
haskell-crypto.scm	…
haskell-web.scm	gnu: Add ghc-js-flot.	2019-09-02 23:09:39 -04:00
haskell-xyz.scm	gnu: idris: Update to 1.3.2.	2019-09-24 21:15:24 -05:00
haskell.scm	gnu: ghc@8.6: Add missing 'native-search-paths'.	2019-09-09 21:21:00 -04:00
hexedit.scm	…
hugs.scm	…
hurd.scm	…
hyperledger.scm	…
i2p.scm	…
ibus.scm	…
icu4c.scm	…
idris.scm	gnu: idris: Update to 1.3.2.	2019-09-24 21:15:24 -05:00
idutils.scm	…
image-processing.scm	gnu: OpenEXR: Update to 2.4.0 [fixes CVE-2018-18443, CVE-2018-18444].	2019-09-24 20:12:56 +02:00
image-viewers.scm	…
image.scm	gnu: freeimage: Update to 3.18.0.	2019-09-25 17:45:39 +02:00
imagemagick.scm	…
inklingreader.scm	…
inkscape.scm	…
ipfs.scm	…
irc.scm	gnu: weechat: Update to 2.6.	2019-09-10 21:37:19 +02:00
iso-codes.scm	…
java-compression.scm	…
java-maths.scm	…
java.scm	…
javascript.scm	gnu: js-datatables: Update to 1.10.19.	2019-09-22 21:20:07 +03:00
jemalloc.scm	…
jose.scm	…
jrnl.scm	…
julia.scm	gnu: julia: Set search path.	2019-09-04 22:18:07 +02:00
jupyter.scm	gnu: Add Xeus.	2019-09-18 23:08:29 +02:00
kawa.scm	…
kde-frameworks.scm	…
kde-plasma.scm	…
kde.scm	gnu: Add kqtquickcharts.	2019-09-16 15:04:26 +03:00
kerberos.scm	…
key-mon.scm	…
kodi.scm	…
language.scm	gnu: Add tegaki-wagomu-traditional-chinese.	2019-09-17 13:31:25 +08:00
ld-wrapper.in	…
lego.scm	…
less.scm	…
lesstif.scm	…
libbsd.scm	…
libcanberra.scm	…
libdaemon.scm	…
libedit.scm	…
libevent.scm	gnu: perl-anyevent: Update to 7.17.	2019-09-20 17:15:38 +02:00
libffcall.scm	…
libffi.scm	…
libftdi.scm	…
libidn.scm	…
libphidget.scm	…
libreoffice.scm	gnu: libvisio: Update to 0.1.7.	2019-09-05 00:21:42 +02:00
libsigsegv.scm	…
libunistring.scm	…
libunwind.scm	…
libusb.scm	gnu: libusb-compat: Don't use NAME in source URI.	2019-08-30 23:10:20 +02:00
license.scm	gnu: Order (gnu packages license)'s imports alphabetically.	2019-09-27 12:28:42 +02:00
lighting.scm	…
linux.scm	gnu: iproute2: Add libmnl input.	2019-09-25 17:50:51 +02:00
lirc.scm	…
lisp.scm	gnu: packages: Fix typos.	2019-09-23 13:15:17 -07:00
llvm.scm	gnu: libomp: Fix test target.	2019-09-23 12:20:31 +02:00
logging.scm	…
logo.scm	…
lolcode.scm	…
lout.scm	…
lsof.scm	…
lua.scm	gnu: Add lua-luv.	2019-09-16 12:26:25 +02:00
lxde.scm	…
lxqt.scm	gnu: qtermwidget: Enable UTF-8 support.	2019-09-07 09:17:34 -04:00
m4.scm	…
machine-learning.scm	…
magic-wormhole.scm	…
mail.scm	gnu: mutt: Update to 1.12.2.	2019-09-21 23:58:39 +02:00
make-bootstrap.scm	…
man.scm	…
markup.scm	gnu: smu: Don't use unstable tarball.	2019-09-28 05:36:12 +02:00
marst.scm	…
mastodon.scm	…
mate.scm	…
maths.scm	gnu: z3: Update to 4.8.6.	2019-09-28 05:36:12 +02:00
maven.scm	…
mc.scm	…
mcrypt.scm	…
medical.scm	…
mes.scm	gnu: mes: Update to 0.20.	2019-09-09 22:57:27 +02:00
messaging.scm	gnu: utox: Update to 0.17.1.	2019-09-23 13:23:10 +02:00
microcom.scm	…
mingw.scm	…
moe.scm	…
monitoring.scm	…
mono.scm	…
moreutils.scm	…
motti.scm	…
mp3.scm	gnu: mpg123: Update to 1.25.12.	2019-08-30 23:10:20 +02:00
mpd.scm	gnu: ncmpc: Update to 0.35.	2019-09-17 16:04:43 +02:00
mpi.scm	…
mtools.scm	…
multiprecision.scm	…
music.scm	gnu: beets: Update to 1.4.9.	2019-09-26 05:24:30 +02:00
musl.scm	…
nano.scm	…
ncdu.scm	…
ncurses.scm	…
netpbm.scm	…
nettle.scm	…
networking.scm	gnu: ubridge: Update to 0.9.16.	2019-09-28 05:36:11 +02:00
nfs.scm	…
nickle.scm	…
nim.scm	…
ninja.scm	…
node.scm	gnu: node: Disable tests that fail with openssl@1.1.1d.	2019-09-20 17:24:02 +02:00
noweb.scm	…
nss.scm	…
ntp.scm	gnu: openntpd: Fix error CA errors when using constraints.	2019-09-08 23:15:31 +09:00
nutrition.scm	…
nvi.scm	…
ocaml.scm	gnu: ocaml-easy-format: Update to 1.3.2.	2019-09-04 23:08:49 +02:00
ocr.scm	gnu: Add python2-zinnia.	2019-09-17 13:29:03 +08:00
onc-rpc.scm	…
openbox.scm	…
opencl.scm	…
openldap.scm	…
openstack.scm	…
orpheus.scm	…
ots.scm	…
package-management.scm	gnu: flatpak: Update to 1.4.3.	2019-09-23 13:12:39 +02:00
parallel.scm	gnu: parallel: Update to 20190922.	2019-09-22 20:00:57 +02:00
password-utils.scm	…
patchutils.scm	…
pciutils.scm	…
pcre.scm	…
pdf.scm	gnu: Add stapler.	2019-09-28 12:12:29 +05:30
pem.scm	…
perl-check.scm	…
perl-compression.scm	gnu: perl-archive-zip: Update to 1.65.	2019-09-11 00:33:50 +02:00
perl-web.scm	…
perl.scm	gnu: perl-clone: Update to 0.43.	2019-09-17 16:04:43 +02:00
perl6.scm	…
phabricator.scm	…
photo.scm	gnu: LibRaw: Update to 1.19.5.	2019-09-05 00:21:41 +02:00
php.scm	gnu: php: Build against Oniguruma 6.	2019-09-05 00:21:41 +02:00
pkg-config.scm	…
plotutils.scm	gnu: asymptote: Update to 2.53.	2019-09-24 10:23:52 +02:00
poedit.scm	…
polkit.scm	…
popt.scm	…
pretty-print.scm	gnu: fmt: Update to 6.0.0.	2019-09-24 20:12:55 +02:00
printers.scm	…
profiling.scm	…
protobuf.scm	…
pth.scm	…
pulseaudio.scm	…
pumpio.scm	…
pure.scm	…
pv.scm	…
python-check.scm	gnu: python-pytest-virtualenv: Enable tests.	2019-09-13 00:10:35 +09:00
python-compression.scm	…
python-crypto.scm	gnu: python-py-bcrypt: Fix typo.	2019-09-23 13:01:34 -07:00
python-web.scm	gnu: python-html2text: Update to 2019.8.11.	2019-09-23 22:03:35 +03:00
python-xyz.scm	gnu: Add python-distro.	2019-09-26 17:18:22 +02:00
python.scm	gnu: micropython: Update to 1.11.	2019-09-08 14:43:15 +03:00
qt.scm	gnu: Add python-pyside-2-tools.	2019-09-22 08:47:52 +02:00
ragel.scm	…
rails.scm	…
ratpoison.scm	…
rdesktop.scm	…
rdf.scm	…
re2c.scm	…
readline.scm	…
rednotebook.scm	gnu: Add rednotebook.	2019-08-29 19:15:14 +02:00
regex.scm	gnu: re2: Update to 2019-09-01.	2019-09-24 20:12:55 +02:00
robotics.scm	…
rrdtool.scm	…
rsync.scm	…
ruby.scm	gnu: Add ruby-rspec-wait.	2019-09-13 15:39:28 +03:00
rush.scm	…
rust.scm	gnu: rust: Update to 1.37.0.	2019-08-29 17:43:44 -07:00
sagemath.scm	…
samba.scm	gnu: samba: Update to 4.11.0.	2019-09-19 16:54:31 +02:00
sawfish.scm	…
scanner.scm	…
scheme.scm	gnu: mit-scheme: Pass a valid tarball hash on non-x86.	2019-09-23 12:14:39 +02:00
screen.scm	…
scribus.scm	…
scsi.scm	…
sdcc.scm	…
sdl.scm	…
search.scm	…
security-token.scm	…
selinux.scm	…
serialization.scm	gnu: nlohmann-json-cpp: Update to 3.7.0.	2019-09-18 23:08:28 +02:00
serveez.scm	…
shells.scm	…
shellutils.scm	gnu: shellutils.scm: Sort module inputs.	2019-09-13 15:39:43 +03:00
simh.scm	…
simulation.scm	…
skarnet.scm	…
skribilo.scm	…
slang.scm	…
smalltalk.scm	…
sml.scm	…
speech.scm	gnu: festival: Fix scripts.	2019-09-18 10:57:12 +02:00
sphinx.scm	gnu: python-sphinxcontrib-htmlhelp: Fix typo.	2019-09-23 12:29:12 -07:00
spice.scm	…
sqlite.scm	…
squirrel.scm	…
ssh.scm	…
sssd.scm	…
stalonetray.scm	…
statistics.scm	gnu: r-dt: Update to 0.9.	2019-09-28 12:24:15 +02:00
stb.scm	…
storage.scm	…
suckless.scm	gnu: Add scron.	2019-09-09 21:53:26 +08:00
swig.scm	…
sync.scm	gnu: rclone: Update to 1.49.3.	2019-09-20 17:15:38 +02:00
syncthing.scm	gnu: go-github-com-audriusbutkevicius-pfilter: Fix typo.	2019-09-23 12:27:01 -07:00
syndication.scm	…
synergy.scm	…
task-management.scm	…
tbb.scm	gnu: tbb: Build in a reproducible fashion.	2019-09-26 23:15:28 +02:00
tcl.scm	…
telephony.scm	gnu: bctoolbox: Fix typo.	2019-09-23 12:21:36 -07:00
terminals.scm	gnu: kitty: Update to 0.14.5.	2019-09-23 13:17:40 +02:00
terraform.scm	…
tex.scm	Merge remote-tracking branch 'origin/master' into wip-texlive	2019-09-18 11:54:54 +02:00
texinfo.scm	gnu: texinfo: Add version 6.7.	2019-09-26 23:15:28 +02:00
text-editors.scm	gnu: fe: Fix typo.	2019-09-23 12:18:41 -07:00
textutils.scm	gnu: recode: Don't use NAME in source URI.	2019-09-11 22:56:04 +02:00
time.scm	…
tls.scm	gnu: mbedtls-apache: Update to 2.16.3.	2019-09-27 18:57:37 +02:00
tmux.scm	…
tor.scm	gnu: tor: Update to 0.4.1.6.	2019-09-19 19:27:37 +02:00
toys.scm	…
tryton.scm	…
tv.scm	…
uml.scm	…
unrtf.scm	…
upnp.scm	gnu: miniupnpc: Update to 2.1.20190824.	2019-09-05 00:21:43 +02:00
usb-modeswitch.scm	gnu: packages: Fix typos.	2019-09-23 13:15:17 -07:00
uucp.scm	…
valgrind.scm	…
version-control.scm	…
video.scm	gnu: youtube-viewer: Update to 3.5.8.	2019-09-28 05:36:11 +02:00
vim.scm	gnu: neovim: Update to 0.4.2.	2019-09-16 12:26:26 +02:00
virtualization.scm	gnu: skopeo: Update to 0.1.39.	2019-09-26 05:24:31 +02:00
vpn.scm	gnu: wireguard: Update to 0.0.20190913.	2019-09-16 14:07:37 +02:00
vulkan.scm	gnu: spirv-tools: Use GIT-FILE-NAME.	2019-09-25 17:50:48 +02:00
w3m.scm	…
wdiff.scm	…
web-browsers.scm	gnu: WebKitGTK: Update to 2.26.1.	2019-09-27 18:57:37 +02:00
web.scm	gnu: nginx: Update to 1.17.4.	2019-09-27 18:57:38 +02:00
webkit.scm	gnu: WebKitGTK: Update to 2.26.1.	2019-09-27 18:57:37 +02:00
wget.scm	gnu: wget2: Update to 1.99.2.	2019-09-08 13:53:26 +03:00
wicd.scm	…
wine.scm	gnu: wine-staging: Update to 4.16.	2019-09-14 13:01:28 +02:00
wireservice.scm	…
wm.scm	gnu: bspwm: Update to 0.9.9.	2019-09-26 05:24:31 +02:00
wordnet.scm	…
wv.scm	…
wxwidgets.scm	…
xdisorg.scm	gnu: xf86-input-wacom: Don't use NAME in source URI.	2019-09-25 17:50:53 +02:00
xfce.scm	gnu: Thunar: Update to 1.8.9.	2019-09-13 10:50:11 +02:00
xfig.scm	…
xiph.scm	…
xml.scm	gnu: java-dom4j: Update to 2.1.1.	2019-09-24 07:06:37 +02:00
xnee.scm	…
xorg.scm	gnu: xbacklight: Update to 1.2.3.	2019-09-27 12:28:43 +02:00
zile.scm	…
zwave.scm	…