Ben Woodcroft 7569613076 gnu: roary: Update to 3.8.2. ... * gnu/packages/bioinformatics.scm (roary): Update to 3.8.2.		2017-05-22 11:44:20 +01:00
..
aux-files	gnu: linux-libre: Remove CONFIG_SMC from x86 kernel configurations.	2017-05-21 01:47:09 -04:00
bootstrap	…
patches	gnu: jbig2dec: Fix CVE-2017-{7885,7975,7976}.	2017-05-20 16:26:29 -04:00
abduco.scm	…
abiword.scm	…
acct.scm	…
acl.scm	…
admin.scm	gnu: shadow: Update to 4.5.	2017-05-17 21:20:29 -04:00
adns.scm	…
aidc.scm	…
algebra.scm	…
android.scm	…
animation.scm	…
anthy.scm	…
apl.scm	…
apr.scm	…
aspell.scm	gnu: aspell: 'dict-dir' set to ~/.guix-profile/lib/aspell or $ASPELL_DICT_DIR.	2017-05-17 16:20:06 +02:00
assembly.scm	…
astronomy.scm	…
attr.scm	…
audio.scm	…
augeas.scm	…
autogen.scm	…
autotools.scm	…
avahi.scm	…
avr.scm	…
backup.scm	gnu: par2cmdline: Update to 0.7.0	2017-05-14 22:05:48 -04:00
base.scm	gnu: glibc/hurd: Do not apply i686 patch.	2017-05-16 22:37:31 +02:00
bash.scm	…
bdw-gc.scm	…
benchmark.scm	gnu: fio: Update to 2.20.	2017-05-21 16:33:42 +02:00
bioinformatics.scm	gnu: roary: Update to 3.8.2.	2017-05-22 11:44:20 +01:00
bison.scm	…
bittorrent.scm	…
boost.scm	…
bootloaders.scm	…
bootstrap.scm	…
build-tools.scm	…
busybox.scm	…
c.scm	…
calcurse.scm	…
calendar.scm	…
ccache.scm	…
cdrom.scm	gnu: Add dvdstyler.	2017-05-10 09:32:50 +02:00
certs.scm	…
check.scm	…
chez.scm	…
ci.scm	gnu: guile-json: Rename "guile2.2-json" to "guile-json".	2017-05-13 22:25:22 +02:00
cmake.scm	…
code.scm	…
commencement.scm	…
compression.scm	…
compton.scm	…
conkeror.scm	…
conky.scm	…
connman.scm	…
cook.scm	…
cpio.scm	…
cppi.scm	…
cross-base.scm	…
crypto.scm	…
cryptsetup.scm	gnu: cryptsetup: Update to 1.7.5.	2017-05-12 13:47:26 +02:00
cups.scm	…
curl.scm	…
cyrus-sasl.scm	…
databases.scm	gnu: postgresql: Update to 9.6.3 [fixes CVE-2017-{7484,7485,7486}].	2017-05-12 19:27:11 +02:00
datamash.scm	…
datastructures.scm	…
dav.scm	…
dc.scm	…
debug.scm	…
dejagnu.scm	…
dico.scm	…
dictionaries.scm	…
direct-connect.scm	…
disk.scm	…
display-managers.scm	…
django.scm	gnu: Add pootle.	2017-05-11 21:58:41 +02:00
djvu.scm	…
dns.scm	gnu: bind: Rename variable to 'isc-bind'.	2017-05-16 00:00:03 +02:00
docbook.scm	…
docker.scm	…
documentation.scm	…
dunst.scm	…
dvtm.scm	…
ebook.scm	gnu: calibre: Don't create uninstaller.	2017-05-19 23:49:21 +02:00
ed.scm	…
education.scm	…
elf.scm	gnu: elfutils: Update to 0.169.	2017-05-11 00:08:20 -04:00
elixir.scm	…
emacs.scm	gnu: Add emacs-helm-projectile.	2017-05-18 14:22:03 +02:00
embedded.scm	…
enchant.scm	…
engineering.scm	gnu: librecad: Use modular Qt.	2017-05-15 21:22:06 +02:00
enlightenment.scm	gnu: enlightenment: Update to 0.21.7.	2017-05-10 11:29:45 +03:00
entr.scm	…
erlang.scm	…
fcitx.scm	…
figlet.scm	…
file-systems.scm	…
file.scm	…
finance.scm	…
firmware.scm	…
flashing-tools.scm	…
flex.scm	…
fltk.scm	…
fonts.scm	gnu: font-liberation: Update source and homepage URLs.	2017-05-10 23:37:23 -04:00
fontutils.scm	…
fpga.scm	…
freedesktop.scm	…
freeipmi.scm	…
fribidi.scm	…
ftp.scm	…
fvwm.scm	…
game-development.scm	gnu: Add python-tmx.	2017-05-10 20:00:50 -04:00
games.scm	gnu: openttd: Update to 1.7.0.	2017-05-17 21:55:01 -04:00
gawk.scm	…
gcal.scm	…
gcc.scm	…
gd.scm	…
gdb.scm	…
geo.scm	…
gettext.scm	…
gforth.scm	…
ghostscript.scm	gnu: ghostscript: Add TODO comment about bundled jbig2dec.	2017-05-20 16:26:29 -04:00
gimp.scm	gnu: gimp: Update to 2.8.22 [fixes CVE-2007-3126].	2017-05-12 21:44:14 -04:00
gkrellm.scm	…
gl.scm	…
glib.scm	…
gnome.scm	gnu: Add gspell.	2017-05-17 16:20:06 +02:00
gnu-doc.scm	…
gnu-pw-mgr.scm	…
gnucash.scm	…
gnunet.scm	…
gnupg.scm	gnu: gnupg: Update to 2.1.21.	2017-05-17 21:48:29 -04:00
gnustep.scm	…
gnuzilla.scm	…
gobby.scm	…
golang.scm	…
gperf.scm	…
gprolog.scm	…
gps.scm	…
graphics.scm	…
graphviz.scm	…
groff.scm	…
gsasl.scm	…
gstreamer.scm	…
gtk.scm	…
guile-wm.scm	…
guile.scm	gnu: guile-json: Rename "guile2.2-json" to "guile-json".	2017-05-13 22:25:22 +02:00
gv.scm	…
gxmessage.scm	…
haskell.scm	…
hexedit.scm	…
hugs.scm	…
hurd.scm	…
ibus.scm	…
icu4c.scm	gnu: Add java-icu4j.	2017-05-15 22:33:16 +02:00
idris.scm	…
idutils.scm	…
image-processing.scm	gnu: Add mia.	2017-05-15 21:34:09 +02:00
image-viewers.scm	…
image.scm	gnu: jbig2dec: Fix CVE-2017-{7885,7975,7976}.	2017-05-20 16:26:29 -04:00
imagemagick.scm	gnu: imagemagick: Update to 6.9.8-6.	2017-05-20 14:06:20 -04:00
indent.scm	…
inklingreader.scm	…
inkscape.scm	…
irc.scm	gnu: weechat: Update to 1.8.	2017-05-14 15:06:26 +02:00
iso-codes.scm	…
java.scm	gnu: icedtea@3: Add aarch32-drop.	2017-05-20 14:57:22 -04:00
jemalloc.scm	…
jrnl.scm	…
julia.scm	…
kde-frameworks.scm	gnu: Update kde frameworks to 5.34.0.	2017-05-15 12:41:08 +02:00
kde.scm	…
kerberos.scm	…
key-mon.scm	…
kodi.scm	…
language.scm	…
ld-wrapper.in	…
ldc.scm	…
lego.scm	…
less.scm	…
lesstif.scm	…
libbsd.scm	…
libcanberra.scm	…
libdaemon.scm	…
libedit.scm	…
libevent.scm	…
libffcall.scm	gnu: libffcall: Update to 1.12.	2017-05-11 13:19:36 +03:00
libffi.scm	…
libftdi.scm	…
libidn.scm	…
libphidget.scm	…
libreoffice.scm	…
libsigsegv.scm	…
libunistring.scm	…
libunwind.scm	…
libupnp.scm	…
libusb.scm	gnu: Add java-usb4java.	2017-05-15 22:33:13 +02:00
lighting.scm	…
linux.scm	gnu: linux-libre: Update to 4.11.2.	2017-05-21 02:03:32 -04:00
lirc.scm	…
lisp.scm	gnu: sbcl-slynk-boot0: Give the package an appropriate name.	2017-05-16 15:18:16 +02:00
llvm.scm	gnu: Add LLVM, CLANG 3.9.1.	2017-05-10 15:34:59 +02:00
logging.scm	gnu: tailon: Use absolute paths for commands.	2017-05-17 16:50:41 +02:00
lolcode.scm	…
lout.scm	…
lsof.scm	…
lua.scm	…
lxde.scm	gnu: lxde-common: Provide 'startlxde' with the 'lxsession' file name.	2017-05-11 23:31:28 +02:00
lxqt.scm	…
m4.scm	…
machine-learning.scm	gnu: Add ocaml4.01-mcl.	2017-05-10 22:13:55 +02:00
mail.scm	gnu: khard: Update to 0.11.4.	2017-05-15 22:27:53 -04:00
make-bootstrap.scm	…
man.scm	…
markdown.scm	…
marst.scm	…
mate.scm	…
maths.scm	gnu: Add ocaml4.01-gsl.	2017-05-10 22:13:54 +02:00
mc.scm	gnu: mc: Add unzip to inputs.	2017-05-18 01:00:53 +02:00
mcrypt.scm	…
mes.scm	gnu: mes: Don't fail when (%current-target-system) is #f.	2017-05-17 16:14:01 +02:00
messaging.scm	…
mg.scm	…
microcom.scm	…
mingw.scm	…
moe.scm	…
monitoring.scm	…
mono.scm	…
moreutils.scm	…
mp3.scm	…
mpd.scm	…
mpi.scm	gnu: hwloc: Update to 1.11.7.	2017-05-11 18:05:42 +02:00
mtools.scm	…
multiprecision.scm	…
music.scm	gnu: Add non-timeline.	2017-05-15 23:01:24 +02:00
musl.scm	…
nano.scm	gnu: nano: Update to 2.8.4.	2017-05-21 16:17:01 +02:00
ncdu.scm	…
ncurses.scm	…
netpbm.scm	…
nettle.scm	…
networking.scm	…
nfs.scm	…
nickle.scm	…
nim.scm	…
ninja.scm	…
node.scm	…
noweb.scm	…
ntp.scm	…
nutrition.scm	…
nvi.scm	…
ocaml.scm	gnu: Add ocaml4.01-batteries.	2017-05-10 22:13:55 +02:00
ocr.scm	…
onc-rpc.scm	…
openbox.scm	…
openldap.scm	…
openstack.scm	…
orpheus.scm	…
ots.scm	…
package-management.scm	gnu: guix: Add 'guile2.0-guix'.	2017-05-20 20:00:53 +02:00
parallel.scm	…
password-utils.scm	gnu: libpwquality: Update source and home-page URLs.	2017-05-10 23:37:19 -04:00
patchutils.scm	…
pciutils.scm	…
pcre.scm	…
pdf.scm	…
pem.scm	…
perl-web.scm	…
perl.scm	…
photo.scm	gnu: Add darktable.	2017-05-10 19:46:55 +02:00
php.scm	gnu: php: Update to 7.1.5.	2017-05-16 22:43:34 +02:00
pkg-config.scm	…
plotutils.scm	…
polkit.scm	…
popt.scm	…
pretty-print.scm	…
protobuf.scm	…
pth.scm	…
pulseaudio.scm	…
pumpio.scm	…
pv.scm	gnu: pv: Use HTTPS.	2017-05-14 14:49:10 +02:00
python.scm	gnu: python-future: Update to 0.16.0.	2017-05-21 15:42:08 +01:00
qemu.scm	gnu: qemu: Fix CVE-2017-7493.	2017-05-17 07:45:01 -04:00
qt.scm	gnu: python-pyqt@4: Update to 4.12.	2017-05-19 21:33:43 +02:00
ragel.scm	…
rails.scm	…
ratpoison.scm	…
rdesktop.scm	…
rdf.scm	…
re2c.scm	…
readline.scm	…
regex.scm	gnu: re2: Update to 2017-05-01.	2017-05-09 20:52:29 +02:00
rrdtool.scm	…
rsync.scm	…
ruby.scm	gnu: ruby-rack: Update to 2.0.3.	2017-05-17 10:29:38 +02:00
rush.scm	…
rust.scm	…
samba.scm	gnu: talloc: Add static variant.	2017-05-12 13:31:34 +02:00
sawfish.scm	…
scanner.scm	…
scheme.scm	…
screen.scm	gnu: reptry: Fix build.	2017-05-12 20:19:13 +02:00
scribus.scm	…
scsi.scm	…
sdcc.scm	…
sdl.scm	…
search.scm	…
security-token.scm	gnu: ccid: Update to 1.4.27.	2017-05-21 16:37:54 +02:00
selinux.scm	…
serialization.scm	…
serveez.scm	…
shells.scm	gnu: Add loksh.	2017-05-20 02:42:04 +02:00
shellutils.scm	…
simh.scm	…
skarnet.scm	…
skribilo.scm	…
slang.scm	…
smalltalk.scm	…
speech.scm	…
spice.scm	…
ssh.scm	gnu: libssh, guile-ssh: Add a "debug" output.	2017-05-20 19:49:36 +02:00
sssd.scm	gnu: bind: Rename variable to 'isc-bind'.	2017-05-16 00:00:03 +02:00
stalonetray.scm	…
statistics.scm	…
storage.scm	…
suckless.scm	…
swig.scm	…
sync.scm	…
syndication.scm	…
synergy.scm	…
task-management.scm	…
tbb.scm	…
tcl.scm	…
telephony.scm	…
terminals.scm	…
tex.scm	…
texinfo.scm	…
text-editors.scm	gnu: Add e3.	2017-05-13 00:03:46 +02:00
textutils.scm	gnu: Add java-rsyntaxtextarea.	2017-05-15 22:33:13 +02:00
time.scm	…
tls.scm	gnu: certbot, python-acme: Update to 0.14.1.	2017-05-16 22:51:25 -04:00
tmux.scm	…
tor.scm	gnu: tor: Update to 0.3.0.7.	2017-05-16 22:26:22 +03:00
tv.scm	…
uml.scm	…
unrtf.scm	…
upnp.scm	gnu: miniupnpc: Fix CVE-2017-8798.	2017-05-12 00:40:28 +02:00
uucp.scm	…
valgrind.scm	…
version-control.scm	gnu: git@2.10: Update to 2.10.3 [fixes CVE-2017-8386].	2017-05-11 01:25:50 -04:00
video.scm	gnu: v4l-utils: Update to 1.12.5.	2017-05-21 17:12:48 +02:00
vim.scm	gnu: vim: Update to 8.0.0600.	2017-05-21 14:34:45 +02:00
vpn.scm	gnu: openvpn: Update to 2.4.2 [fixes CVE-2017-7478, CVE-2017-7479].	2017-05-12 15:22:56 +02:00
vtk.scm	…
w3m.scm	…
wdiff.scm	…
web-browsers.scm	…
web.scm	gnu: Add http-parser.	2017-05-15 21:24:43 +02:00
webkit.scm	gnu: webkitgtk: Update to 2.16.2.	2017-05-10 05:48:52 -04:00
wget.scm	…
wicd.scm	…
wine.scm	…
wm.scm	…
wordnet.scm	…
wv.scm	…
wxwidgets.scm	gnu: Add wxsvg.	2017-05-10 09:32:49 +02:00
xdisorg.scm	…
xfce.scm	…
xfig.scm	…
xiph.scm	…
xml.scm	gnu: Add java-simple-xml.	2017-05-15 22:33:14 +02:00
xnee.scm	…
xorg.scm	…
zile.scm	…
zip.scm	…