Ricardo Wurmus b113f39019 gnu: gemma: Fetch sources from git. ... * gnu/packages/bioinformatics.scm (gemma)[source]: Fetch from git.		2018-11-07 20:26:45 +01:00
..
aux-files	gnu: linux-libre: Enable BOCHS DRM support.	2018-10-28 20:42:50 +09:00
bootstrap	…
patches	gnu: libgit2: Work around test failures on 32-bit platforms.	2018-11-06 17:08:46 +01:00
abduco.scm	…
abiword.scm	…
accessibility.scm	…
acct.scm	…
acl.scm	…
ada.scm	…
admin.scm	…
adns.scm	Revert "gnu: c-ares: Update to 1.15.0."	2018-11-06 12:22:02 +02:00
agda.scm	…
aidc.scm	…
algebra.scm	…
android.scm	…
animation.scm	…
anthy.scm	…
apl.scm	…
apr.scm	…
aspell.scm	…
assembly.scm	…
astronomy.scm	…
attr.scm	…
audio.scm	gnu: bs1770gain: Update to 0.5.1.	2018-10-23 03:14:30 +02:00
augeas.scm	…
authentication.scm	…
autogen.scm	…
autotools.scm	…
avahi.scm	…
avr.scm	…
axoloti.scm	…
backup.scm	…
base.scm	…
bash.scm	…
batik.scm	…
bdw-gc.scm	…
benchmark.scm	…
bioconductor.scm	gnu: r-regioner: Update to 1.14.0.	2018-11-07 12:26:33 +01:00
bioinformatics.scm	gnu: gemma: Fetch sources from git.	2018-11-07 20:26:45 +01:00
bison.scm	…
bittorrent.scm	…
boost.scm	…
bootloaders.scm	…
bootstrap.scm	…
build-tools.scm	gnu: Add GN.	2018-10-22 23:01:18 +02:00
busybox.scm	…
c.scm	gnu: libbytesize: Update to 1.4.	2018-10-24 04:56:23 +02:00
calcurse.scm	gnu: calcurse: Use HTTPS URLs.	2018-10-29 20:45:57 -04:00
calendar.scm	…
ccache.scm	…
cdrom.scm	…
certs.scm	…
check.scm	gnu: cppcheck: Update to 1.85.	2018-10-23 03:14:31 +02:00
chemistry.scm	…
chez.scm	…
ci.scm	gnu: cuirass: Update to 0b40dca.	2018-11-07 16:06:42 +01:00
cinnamon.scm	…
cluster.scm	…
cmake.scm	…
cobol.scm	…
code.scm	gnu: cloc: Update to 1.80.	2018-10-30 23:40:42 +01:00
commencement.scm	…
compression.scm	gnu: libmspack: Update to 0.8 [fixes CVE-2018-{18584,18585,18586}].	2018-10-27 20:04:20 -04:00
compton.scm	…
conkeror.scm	…
conky.scm	…
connman.scm	…
cook.scm	…
cpio.scm	…
cpp.scm	…
cppi.scm	…
cran.scm	gnu: r-pander: Update to 0.6.3.	2018-11-07 12:26:33 +01:00
cross-base.scm	…
crypto.scm	gnu: libmd: Update to 1.0.1.	2018-10-22 23:01:18 +02:00
cryptsetup.scm	…
cups.scm	gnu: hplip: Update home page.	2018-10-26 02:30:52 +02:00
curl.scm	gnu: curl: Update grafted replacement to 7.62.0 [security fixes].	2018-10-31 13:54:20 -04:00
cyrus-sasl.scm	…
databases.scm	gnu: qt: Use system sqlite.	2018-10-28 09:51:25 +02:00
datamash.scm	…
datastructures.scm	…
dav.scm	…
dc.scm	…
debian.scm	gnu: debian-archive-keyring: Update to 2018.1.	2018-11-04 12:00:13 +02:00
debug.scm	…
dejagnu.scm	…
dico.scm	…
dictionaries.scm	gnu: grammalecte: Update home page.	2018-10-23 09:59:16 +02:00
digest.scm	…
direct-connect.scm	…
disk.scm	…
display-managers.scm	…
django.scm	…
djvu.scm	…
dlang.scm	…
dns.scm	gnu: dnsmasq: Update to 2.80 [security fixes].	2018-10-26 02:30:52 +02:00
docbook.scm	…
docker.scm	…
documentation.scm	…
dunst.scm	…
dvtm.scm	…
ebook.scm	…
ed.scm	…
education.scm	gnu: snap: Update to 4.2.2.2.	2018-10-22 15:56:38 +02:00
electronics.scm	gnu: pulseview: Update to 0.4.1.	2018-10-30 23:40:42 +01:00
elf.scm	…
elixir.scm	…
emacs.scm	gnu: emacs-mu4e-conversation: Update to 20181105.	2018-11-05 20:22:06 +01:00
embedded.scm	…
emulators.scm	gnu: mame: Update to 0.203.	2018-11-01 09:24:52 +01:00
enchant.scm	…
engineering.scm	…
enlightenment.scm	…
entr.scm	…
erlang.scm	…
fabric-management.scm	…
fcitx.scm	…
figlet.scm	…
file-systems.scm	gnu: disorderfs: Update to 0.5.5.	2018-10-30 23:40:42 +01:00
file.scm	…
finance.scm	…
firmware.scm	…
flashing-tools.scm	…
flex.scm	…
fltk.scm	…
fonts.scm	…
fontutils.scm	…
forth.scm	…
fpga.scm	gnu: yosys: Don't use unstable tarball.	2018-10-30 23:40:43 +01:00
freedesktop.scm	…
freeipmi.scm	…
fribidi.scm	…
ftp.scm	…
fvwm.scm	…
game-development.scm	gnu: sfml: Update to 2.5.1.	2018-10-25 04:59:33 +02:00
games.scm	gnu: xonotic: Add icon and category to desktop files.	2018-11-05 00:08:47 +01:00
gawk.scm	…
gcal.scm	…
gcc.scm	…
gd.scm	…
gdb.scm	…
geo.scm	…
gettext.scm	…
ghostscript.scm	…
gimp.scm	…
gkrellm.scm	…
gl.scm	…
glib.scm	gnu: appstream-glib: Update to 0.7.14.	2018-10-21 17:57:00 +02:00
gnome.scm	gnu: libsoup: Update to 2.64.2.	2018-11-05 23:46:37 +01:00
gnu-doc.scm	…
gnu-pw-mgr.scm	…
gnucash.scm	…
gnunet.scm	…
gnupg.scm	gnu: GnuPG: Update to 2.2.11.	2018-11-06 17:26:45 -05:00
gnustep.scm	…
gnuzilla.scm	gnu: icecat: Add fixes from mozilla-esr60 [security fixes].	2018-10-23 19:41:47 -04:00
gobby.scm	…
golang.scm	gnu: go-github-com-urfave-cli: Remove duplicate declaration.	2018-11-04 23:33:24 +01:00
gperf.scm	…
gprolog.scm	…
gps.scm	gnu: gama: Update to 2.01.	2018-10-27 04:47:18 +02:00
graph.scm	gnu: r-rgraphviz: Update to 2.26.0.	2018-11-07 12:26:33 +01:00
graphics.scm	…
graphviz.scm	…
groff.scm	…
groovy.scm	…
gsasl.scm	…
gstreamer.scm	…
gtk.scm	…
guile-wm.scm	…
guile.scm	gnu: Add guile-newt.	2018-11-07 18:09:30 +09:00
gv.scm	…
gxmessage.scm	…
ham-radio.scm	…
hardware.scm	gnu: Add wavemon.	2018-10-24 03:58:20 +02:00
haskell-check.scm	…
haskell-crypto.scm	…
haskell-web.scm	…
haskell.scm	…
hexedit.scm	…
hugs.scm	…
hurd.scm	…
ibus.scm	…
icu4c.scm	…
idris.scm	…
idutils.scm	…
image-processing.scm	…
image-viewers.scm	gnu: feh: Update to 2.28.1.	2018-11-05 23:46:37 +01:00
image.scm	gnu: Add jp2a.	2018-10-26 21:16:13 +02:00
imagemagick.scm	…
inklingreader.scm	…
inkscape.scm	…
ipfs.scm	gnu: Add gx-go.	2018-10-24 14:41:44 +02:00
irc.scm	…
iso-codes.scm	…
java.scm	…
javascript.scm	gnu: mujs: Install shared library.	2018-10-30 11:03:48 +02:00
jemalloc.scm	…
jrnl.scm	…
julia.scm	gnu: julia: Update objconv input to 2018-10-07.	2018-11-01 04:32:35 +01:00
kde-frameworks.scm	…
kde.scm	gnu: Add libkscreen.	2018-10-24 22:37:24 +08:00
kerberos.scm	…
key-mon.scm	…
kodi.scm	gnu: kodi: Fix typo.	2018-11-07 10:38:13 +02:00
language.scm	…
ld-wrapper.in	…
lego.scm	…
less.scm	…
lesstif.scm	…
libbsd.scm	…
libcanberra.scm	…
libdaemon.scm	…
libedit.scm	…
libevent.scm	…
libffcall.scm	…
libffi.scm	…
libftdi.scm	…
libidn.scm	…
libphidget.scm	…
libreoffice.scm	gnu: LibreOffice: Update to 6.1.3.2.	2018-11-06 23:13:50 -05:00
libsigsegv.scm	…
libunistring.scm	…
libunwind.scm	…
libusb.scm	gnu: libmtp: Update to 1.1.16.	2018-11-05 23:46:38 +01:00
license.scm	…
lighting.scm	…
linux.scm	gnu: strace: Update to 4.25.	2018-11-05 23:46:38 +01:00
lirc.scm	…
lisp.scm	gnu: sbcl-lift: Don't keep the bundled website.	2018-11-03 20:43:35 +02:00
llvm.scm	…
logging.scm	…
lolcode.scm	…
lout.scm	…
lsof.scm	…
lua.scm	gnu: Add lua5.1-lpeg and lua5.1-lmpack.	2018-10-26 21:17:00 +02:00
lxde.scm	…
lxqt.scm	gnu: lxqt-build-tools: Define LXQT_DATA_DIR and LXQT_ETC_XDG_DIR.	2018-10-27 19:50:41 +08:00
m4.scm	…
machine-learning.scm	…
mail.scm	gnu: mpop: Update to 1.4.0.	2018-11-04 10:36:17 +05:30
make-bootstrap.scm	…
man.scm	…
markup.scm	…
marst.scm	…
mate.scm	…
maths.scm	gnu: Add hdf5-1.10.	2018-11-07 12:26:33 +01:00
maven.scm	…
mc.scm	…
mcrypt.scm	…
medical.scm	…
mes.scm	…
messaging.scm	gnu: quaternion: Update to 0.0.9.3.	2018-10-31 09:31:59 +05:30
microcom.scm	…
mingw.scm	…
moe.scm	…
monitoring.scm	gnu: Add fswatch.	2018-11-05 03:01:21 +01:00
mono.scm	gnu: mono: Update home page.	2018-11-05 23:46:37 +01:00
moreutils.scm	…
motti.scm	…
mp3.scm	…
mpd.scm	gnu: MPD: Update to 0.20.23.	2018-11-01 15:30:05 -04:00
mpi.scm	…
mtools.scm	…
multiprecision.scm	…
music.scm	gnu: clementine: Build with sqlite-with-column-metadata.	2018-11-07 14:25:07 -05:00
musl.scm	…
nano.scm	…
ncdu.scm	…
ncurses.scm	…
netpbm.scm	…
nettle.scm	…
networking.scm	gnu: whois: Update to 5.4.0.	2018-11-01 04:34:25 +01:00
nfs.scm	…
nickle.scm	…
nim.scm	…
ninja.scm	…
node.scm	…
noweb.scm	…
ntp.scm	…
nutrition.scm	…
nvi.scm	…
ocaml.scm	…
ocr.scm	…
onc-rpc.scm	…
openbox.scm	…
opencl.scm	…
openldap.scm	…
openstack.scm	…
orpheus.scm	…
ots.scm	…
package-management.scm	gnu: diffoscope: Update to 104.	2018-11-03 15:16:02 +01:00
parallel.scm	gnu: parallel: Update to 20181022.	2018-10-27 04:47:19 +02:00
password-utils.scm	gnu: hashcat-utils: Update to 1.9.	2018-10-28 02:34:07 +01:00
patchutils.scm	…
pciutils.scm	…
pcre.scm	…
pdf.scm	gnu: zathura-pdf-mupdf: Simplify arguments.	2018-10-30 11:15:40 +02:00
pem.scm	…
perl-check.scm	…
perl-web.scm	…
perl.scm	…
photo.scm	gnu: libgphoto2: Update to 2.5.20.	2018-11-05 23:46:38 +01:00
php.scm	…
pkg-config.scm	…
plotutils.scm	…
polkit.scm	…
popt.scm	…
pretty-print.scm	gnu: highlight: Update to 3.47.	2018-11-01 04:34:25 +01:00
printers.scm	…
profiling.scm	…
protobuf.scm	…
pth.scm	…
pulseaudio.scm	…
pumpio.scm	…
pure.scm	…
pv.scm	…
python-crypto.scm	gnu: python-pynacl: Update to 1.3.0.	2018-11-01 04:34:24 +01:00
python-web.scm	gnu: Add python-mechanicalsoup.	2018-10-24 21:34:22 +02:00
python.scm	gnu: python-ilinkedlist: Update to 0.2.0.	2018-11-05 00:08:47 +01:00
qt.scm	gnu: qt@4: Use invoke.	2018-10-28 09:52:46 +02:00
ragel.scm	…
rails.scm	…
ratpoison.scm	…
rdesktop.scm	…
rdf.scm	…
re2c.scm	…
readline.scm	…
regex.scm	gnu: re2: Update to 2018-10-01.	2018-10-21 17:57:01 +02:00
robotics.scm	…
rrdtool.scm	…
rsync.scm	…
ruby.scm	gnu: ruby-rack: Update to 2.0.6 [fixes CVE-2018-{16470,16471}].	2018-11-05 16:22:11 -05:00
rush.scm	…
rust.scm	gnu: rust: Remove binary bootstrapper.	2018-10-30 20:42:00 +01:00
samba.scm	gnu: samba: Update to 4.8.6.	2018-10-22 23:01:18 +02:00
sawfish.scm	…
scanner.scm	…
scheme.scm	…
screen.scm	…
scribus.scm	…
scsi.scm	…
sdcc.scm	…
sdl.scm	gnu: sdl2: Update to 2.0.9.	2018-11-01 08:20:13 +01:00
search.scm	gnu: xapian: Update to 1.4.9.	2018-11-05 23:46:38 +01:00
security-token.scm	gnu: pcsc-lite: Update to 1.8.24.	2018-10-24 05:59:36 +02:00
selinux.scm	…
serialization.scm	gnu: flatbuffers: Fix typo in description.	2018-10-28 02:34:06 +01:00
serveez.scm	…
shells.scm	gnu: loksh: Use PREFIX.	2018-10-24 21:34:20 +02:00
shellutils.scm	gnu: fzy: Update to 1.0.	2018-10-28 02:34:07 +01:00
simh.scm	…
simulation.scm	…
skarnet.scm	…
skribilo.scm	…
slang.scm	gnu: slang: Use a correct location for terminfo dirs.	2018-11-07 18:39:19 +09:00
smalltalk.scm	…
sml.scm	…
speech.scm	…
spice.scm	…
ssh.scm	gnu: libssh: Update to 0.7.7.	2018-11-05 23:46:38 +01:00
sssd.scm	…
stalonetray.scm	…
statistics.scm	gnu: r-modelmetrics: Update to 1.2.2.	2018-11-07 12:26:34 +01:00
stb.scm	…
storage.scm	…
suckless.scm	…
swig.scm	…
sync.scm	…
syncthing.scm	gnu: Syncthing: Update to 0.14.52.	2018-11-06 11:16:22 -05:00
syndication.scm	…
synergy.scm	…
task-management.scm	…
tbb.scm	…
tcl.scm	…
telephony.scm	…
terminals.scm	gnu: terminals: Change libtsm and kmscon repositories.	2018-11-07 18:27:01 +09:00
terraform.scm	gnu: terraform-docs: Update to 0.5.0.	2018-11-06 15:34:36 +01:00
tex.scm	gnu: Add texlive-latex-examplep.	2018-10-21 23:06:46 +02:00
texinfo.scm	…
text-editors.scm	…
textutils.scm	gnu: oniguruma: Update to 6.9.0.	2018-11-01 04:34:24 +01:00
time.scm	…
tls.scm	…
tmux.scm	gnu: tmux: Update to 2.8.	2018-10-19 03:18:57 +02:00
tor.scm	gnu: tor: Update to 0.3.4.9.	2018-11-02 19:51:12 +01:00
toys.scm	…
tryton.scm	…
tv.scm	…
uml.scm	…
unrtf.scm	…
upnp.scm	…
uucp.scm	…
valgrind.scm	…
version-control.scm	gnu: libgit2: Work around test failures on 32-bit platforms.	2018-11-06 17:08:46 +01:00
video.scm	gnu: youtube-dl: Update to 2018.11.03.	2018-11-06 15:34:37 +01:00
vim.scm	…
virtualization.scm	…
vpn.scm	gnu: gvpe: Update to 3.1.	2018-10-27 04:47:18 +02:00
vulkan.scm	gnu: vulkan-headers: Update to 1.1.85.0.	2018-10-19 08:43:29 +02:00
w3m.scm	…
wdiff.scm	…
web-browsers.scm	…
web.scm	gnu: nginx: Update to 1.14.1 [security fixes].	2018-11-06 21:34:30 +01:00
webkit.scm	gnu: webkitgtk@2.22: Update to 2.22.3.	2018-10-31 01:47:52 -04:00
wget.scm	…
wicd.scm	…
wine.scm	gnu: wine-staging: Update to 3.19.	2018-10-31 09:39:55 +01:00
wm.scm	gnu: i3-wm: Update to 4.16.	2018-11-05 23:46:38 +01:00
wordnet.scm	…
wv.scm	…
wxwidgets.scm	…
xdisorg.scm	gnu: Add xrandr-invert-colors.	2018-10-27 18:54:39 +02:00
xfce.scm	…
xfig.scm	…
xiph.scm	gnu: icecast: Update to 2.4.4 [fixes CVE-2018-18820].	2018-11-01 12:33:14 -04:00
xml.scm	gnu: perl-xml-xpath: Update to 1.44.	2018-10-28 02:34:06 +01:00
xnee.scm	…
xorg.scm	gnu: Add xcb-util-errors.	2018-11-06 17:00:02 +01:00
zile.scm	…