Ricardo Wurmus d7e3299987 gnu: r-scran: Update to 1.8.2. ... * gnu/packages/bioinformatics.scm (r-scran): Update to 1.8.2. [propagated-inputs]: Remove r-zoo; add r-delayedmatrixstats and r-delayedarray.		2018-06-02 13:39:13 +02:00
..
aux-files	gnu: linux-libre: Enable build for aarch64-linux.	2018-05-21 00:12:02 +02:00
bootstrap	…
patches	gnu: sddm: Fix CMake build.	2018-06-01 12:17:00 +02:00
abduco.scm	…
abiword.scm	…
accessibility.scm	gnu: footswitch: Update to ca43d53f.	2018-05-25 14:01:40 +02:00
acct.scm	…
acl.scm	…
ada.scm	…
admin.scm	gnu: thefuck: Update to 3.27.	2018-05-29 20:43:37 +02:00
adns.scm	…
agda.scm	…
aidc.scm	gnu: qrencode: Update to 4.0.0.	2018-05-04 21:46:16 -04:00
algebra.scm	gnu: eigen: Include unsupported features.	2018-05-29 18:20:38 -04:00
android.scm	gnu: android-make-stub: Update to 0.6.0.	2018-05-10 15:35:28 +02:00
animation.scm	…
anthy.scm	…
apl.scm	…
apr.scm	…
aspell.scm	…
assembly.scm	…
astronomy.scm	…
attr.scm	…
audio.scm	gnu: supercollider: Remove broken Qt dependency.	2018-05-28 22:49:55 +02:00
augeas.scm	…
autogen.scm	…
autotools.scm	…
avahi.scm	gnu: nss-mdns: Update to 0.14.1.	2018-05-01 16:01:39 +02:00
avr.scm	…
axoloti.scm	…
backup.scm	…
base.scm	…
bash.scm	…
bdw-gc.scm	…
benchmark.scm	gnu: fio: Use INVOKE.	2018-04-26 21:08:58 +02:00
bioconductor.scm	gnu: r-qdnaseq: Update to 1.16.0.	2018-06-02 13:39:06 +02:00
bioinformatics.scm	gnu: r-scran: Update to 1.8.2.	2018-06-02 13:39:13 +02:00
bison.scm	…
bittorrent.scm	gnu: aria2: Update to 1.34.0.	2018-05-21 13:25:34 +03:00
boost.scm	gnu: Use HTTPS for www.boost.org.	2018-05-01 06:51:15 +02:00
bootloaders.scm	system: Add u-boot-puma-rk3399.	2018-05-29 10:46:13 +02:00
bootstrap.scm	…
build-tools.scm	gnu: bear: Fix python path.	2018-05-31 18:13:08 +02:00
busybox.scm	…
c.scm	gnu: tcc-wrapper: Use Guile 2.2.	2018-04-30 23:41:21 +02:00
calcurse.scm	…
calendar.scm	gnu: khal: Use INVOKE.	2018-05-31 04:54:56 +02:00
ccache.scm	…
cdrom.scm	…
certs.scm	…
check.scm	gnu: Add catch-framework2.	2018-05-28 13:39:57 +02:00
chemistry.scm	…
chez.scm	…
ci.scm	…
cinnamon.scm	…
cmake.scm	gnu: cmake.scm: Add missing module.	2018-05-22 17:37:14 +03:00
cobol.scm	…
code.scm	gnu: Add amalgamate.	2018-05-28 13:45:39 +02:00
commencement.scm	gnu: Use "code" instead of "indent".	2018-05-23 13:59:46 +02:00
compression.scm	gnu: Add squashfs-tools-next.	2018-05-28 17:36:08 +02:00
compton.scm	…
conkeror.scm	…
conky.scm	…
connman.scm	gnu: connman: Update to 1.36.	2018-05-23 15:29:35 +02:00
cook.scm	…
cpio.scm	…
cpp.scm	gnu: Add xtl.	2018-05-28 14:19:29 +02:00
cppi.scm	…
cran.scm	gnu: r-mice: Update to 3.0.0.	2018-05-31 13:21:31 +02:00
cross-base.scm	…
crypto.scm	gnu: rhash: Update to 1.3.6.	2018-04-30 21:36:10 +02:00
cryptsetup.scm	…
cups.scm	gnu: escpr: Update to 1.6.20.	2018-04-28 23:28:02 +02:00
curl.scm	gnu: curl: Update replacement to 7.60.0 [Fixes CVE-2018-{1000300,1000301}].	2018-05-21 13:34:18 -04:00
cyrus-sasl.scm	…
databases.scm	gnu: r-rmysql: Update to 0.10.15.	2018-05-31 13:21:31 +02:00
datamash.scm	…
datastructures.scm	…
dav.scm	…
dc.scm	…
debian.scm	…
debug.scm	gnu: Use "code" instead of "indent".	2018-05-23 13:58:40 +02:00
dejagnu.scm	…
dico.scm	…
dictionaries.scm	…
digest.scm	…
direct-connect.scm	…
disk.scm	gnu: duperemove: Update to 0.11.	2018-05-31 04:54:58 +02:00
display-managers.scm	gnu: sddm: Fix CMake build.	2018-06-01 12:17:00 +02:00
django.scm	…
djvu.scm	…
dns.scm	gnu: knot: Update to 2.6.7.	2018-05-31 04:54:58 +02:00
docbook.scm	…
docker.scm	…
documentation.scm	…
dunst.scm	gnu: dunst: Update to 1.3.2.	2018-05-17 01:01:54 +02:00
dvtm.scm	…
ebook.scm	…
ed.scm	…
education.scm	gnu: tipp10: Use INVOKE.	2018-05-31 04:54:52 +02:00
electronics.scm	…
elf.scm	…
elixir.scm	…
emacs.scm	gnu: emacs-elfeed: Update to 3.0.0.	2018-06-02 13:05:08 +02:00
embedded.scm	…
emulators.scm	gnu: Add scummvm.	2018-05-25 23:19:58 +02:00
enchant.scm	…
engineering.scm	gnu: Add missing copyright line.	2018-05-29 15:43:13 +02:00
enlightenment.scm	gnu: enlightenment: Fix setuid program locations.	2018-05-20 21:42:25 +03:00
entr.scm	…
erlang.scm	…
fabric-management.scm	…
fcitx.scm	…
figlet.scm	…
file-systems.scm	gnu: disorderfs: Update to 0.5.3.	2018-05-29 20:43:37 +02:00
file.scm	…
finance.scm	…
firmware.scm	system: Add u-boot-puma-rk3399.	2018-05-29 10:46:13 +02:00
flashing-tools.scm	…
flex.scm	gnu: Use "code" instead of "indent".	2018-05-23 13:59:46 +02:00
fltk.scm	…
fonts.scm	gnu: DejaVu fonts: Update the home-page.	2018-05-07 17:45:27 -04:00
fontutils.scm	…
forth.scm	…
fpga.scm	…
freedesktop.scm	gnu: xdg-utils: Update to 1.1.3 [fixes CVE-2017-18266].	2018-05-29 14:39:22 -04:00
freeipmi.scm	gnu: freeipmi: Update to 1.6.2.	2018-05-05 13:16:32 +02:00
fribidi.scm	…
ftp.scm	gnu: filezilla: Update to 0.12.2.	2018-05-15 14:39:12 +02:00
fvwm.scm	…
game-development.scm	gnu: tiled: Update to 1.1.5.	2018-05-29 21:20:27 -04:00
games.scm	gnu: 0ad: Update to 0.0.23-alpha.	2018-05-31 00:21:47 -04:00
gawk.scm	…
gcal.scm	…
gcc.scm	gnu: gcc > 5: Use 'CPATH' instead of 'C_INCLUDE_PATH' & co.	2018-05-07 12:02:23 +02:00
gd.scm	…
gdb.scm	…
geo.scm	gnu: gdal: Fix configure flags.	2018-05-24 22:14:31 +02:00
gettext.scm	…
ghostscript.scm	…
gimp.scm	gnu: gimp-fourier: Fix build.	2018-05-23 10:08:20 +02:00
gkrellm.scm	…
gl.scm	gnu: gl.scm: Don't import 'zip' from srfi-1.	2018-05-01 19:31:23 +03:00
glib.scm	…
gnome.scm	gnu: vte: Update to 0.52.2.	2018-05-26 17:04:17 +02:00
gnu-doc.scm	…
gnu-pw-mgr.scm	…
gnucash.scm	…
gnunet.scm	gnu: gnurl: Update to 7.60.0.	2018-05-24 12:13:52 -04:00
gnupg.scm	gnu: pius: Fix incompatibility with newer GnuPG versions.	2018-05-21 17:05:56 +02:00
gnustep.scm	…
gnuzilla.scm	gnu: icecat: Add more fixes from upstream esr52.	2018-06-01 12:51:43 -04:00
gobby.scm	…
golang.scm	gnu: Add go-github-com-gorilla-context.	2018-05-29 18:39:08 -04:00
gperf.scm	…
gprolog.scm	…
gps.scm	…
graph.scm	…
graphics.scm	…
graphviz.scm	gnu: python-graphviz: Update to 0.8.3.	2018-05-17 01:01:58 +02:00
groff.scm	gnu: groff-minimal: Preserve 'preconv' executable.	2018-05-06 15:47:20 +02:00
groovy.scm	gnu: Add groovy.	2018-05-09 13:37:19 +02:00
gsasl.scm	…
gstreamer.scm	gnu: gst-plugins-ugly: Remove libmad from the build environment.	2018-05-12 16:19:58 -04:00
gtk.scm	…
guile-wm.scm	…
guile.scm	gnu: Add guile-sparql.	2018-05-19 23:22:24 +02:00
gv.scm	…
gxmessage.scm	…
ham-radio.scm	…
haskell-check.scm	gnu: Add ghc-quickcheck-2.9.	2018-05-13 23:16:16 +02:00
haskell-crypto.scm	…
haskell-web.scm	…
haskell.scm	gnu: Add ghc-disk-free-space.	2018-06-01 13:50:27 +02:00
hexedit.scm	…
hugs.scm	…
hurd.scm	…
ibus.scm	…
icu4c.scm	…
idris.scm	…
idutils.scm	…
image-processing.scm	gnu: opencv: Ignore CVEs.	2018-05-14 23:01:36 +02:00
image-viewers.scm	gnu: feh: Update to 2.26.3.	2018-05-26 17:04:17 +02:00
image.scm	gnu: gifsicle: New variable.	2018-05-26 22:22:16 +02:00
imagemagick.scm	gnu: graphicsmagick: Update to 1.3.29.	2018-05-17 01:01:57 +02:00
inklingreader.scm	…
inkscape.scm	gnu: inkscape: Disable "icon-theme.cache" generation.	2018-05-15 14:30:23 +02:00
irc.scm	gnu: quassel: Use HTTPS home page.	2018-04-27 02:56:45 +02:00
iso-codes.scm	…
java.scm	gnu: Add java-logback-classic.	2018-05-27 18:47:15 +02:00
javascript.scm	gnu: Add js-filesaver.	2018-05-11 10:35:41 +02:00
jemalloc.scm	…
jrnl.scm	…
julia.scm	gnu: Use HTTPS for julialang.org home pages.	2018-04-29 03:29:48 +02:00
kde-frameworks.scm	gnu: phonon: Update to 4.10.1.	2018-05-17 01:01:57 +02:00
kde.scm	…
kerberos.scm	…
key-mon.scm	…
kodi.scm	…
language.scm	…
ld-wrapper.in	…
ldc.scm	…
lego.scm	…
less.scm	…
lesstif.scm	…
libbsd.scm	…
libcanberra.scm	…
libdaemon.scm	…
libedit.scm	…
libevent.scm	…
libffcall.scm	…
libffi.scm	…
libftdi.scm	…
libidn.scm	…
libphidget.scm	…
libreoffice.scm	gnu: libreoffice: Update to 5.4.7.2.	2018-05-16 22:18:13 -07:00
libsigsegv.scm	…
libunistring.scm	…
libunwind.scm	…
libusb.scm	…
license.scm	…
lighting.scm	…
linux.scm	gnu: linux-libre@4.14: Update to 4.14.47.	2018-05-31 04:17:22 -04:00
lirc.scm	…
lisp.scm	…
llvm.scm	…
logging.scm	…
lolcode.scm	…
lout.scm	…
lsof.scm	…
lua.scm	…
lxde.scm	gnu: libfm: Update to 1.3.0.2.	2018-05-17 01:02:00 +02:00
lxqt.scm	…
m4.scm	…
machine-learning.scm	gnu: r-kernlab: Update to 0.9-26.	2018-05-31 13:21:31 +02:00
mail.scm	gnu: isync: Add zlib compression support.	2018-05-30 23:46:53 +02:00
make-bootstrap.scm	…
man.scm	Revert "gnu: man-db: Embed absolute reference to 'preconv'."	2018-05-06 23:55:50 +02:00
markup.scm	…
marst.scm	…
mate.scm	…
maths.scm	gnu: octave: Update to 4.4.0.	2018-05-29 18:20:37 -04:00
maven.scm	…
mc.scm	…
mcrypt.scm	…
medical.scm	…
mes.scm	gnu: mes: Update to 0.14.	2018-05-24 07:50:04 +02:00
messaging.scm	gnu: prosody: Update to 0.10.2 [fixes CVE-2018-10847].	2018-05-31 20:31:46 -04:00
microcom.scm	…
mingw.scm	…
moe.scm	…
monitoring.scm	…
mono.scm	…
moreutils.scm	…
motti.scm	…
mp3.scm	…
mpd.scm	gnu: mpd: Update to 0.20.20.	2018-05-29 18:00:34 -04:00
mpi.scm	gnu: openmpi: Add PSM2 (Intel OmniPath) support.	2018-05-25 13:43:03 +02:00
mtools.scm	…
multiprecision.scm	…
music.scm	gnu: clementine: Update snapshot.	2018-05-27 22:33:06 +03:00
musl.scm	…
nano.scm	gnu: nano: Update to 2.9.7.	2018-05-15 22:24:07 -05:00
ncdu.scm	…
ncurses.scm	…
netpbm.scm	…
nettle.scm	…
networking.scm	gnu: wireshark: End phase with #t.	2018-05-30 11:02:52 +02:00
nfs.scm	…
nickle.scm	…
nim.scm	…
ninja.scm	…
node.scm	…
noweb.scm	…
ntp.scm	…
nutrition.scm	…
nvi.scm	…
ocaml.scm	gnu: coq-coquelicot: Fix for coq 8.8.	2018-05-04 21:30:58 +02:00
ocr.scm	…
onc-rpc.scm	…
openbox.scm	…
openldap.scm	…
openstack.scm	gnu: python-oslo.utils: Update to 3.36.2.	2018-05-30 10:06:57 +02:00
orpheus.scm	…
ots.scm	…
package-management.scm	gnu: diffoscope: Update to 94.	2018-05-11 18:42:43 +02:00
parallel.scm	gnu: parallel: Update to 20180522.	2018-05-23 15:29:33 +02:00
password-utils.scm	gnu: Add pass-rotate.	2018-05-14 19:12:32 +05:30
patchutils.scm	…
pciutils.scm	…
pcre.scm	…
pdf.scm	gnu: mupdf: Update to 1.13.0.	2018-05-14 12:09:40 +03:00
pem.scm	…
perl-check.scm	gnu: perl-test-notabs: Update to 2.02.	2018-04-27 02:56:41 +02:00
perl-web.scm	…
perl.scm	gnu: perl-text-format: Update to 0.61.	2018-05-30 10:06:57 +02:00
photo.scm	gnu: libraw: Update to 0.18.11.	2018-05-17 01:01:59 +02:00
php.scm	…
pkg-config.scm	…
plotutils.scm	gnu: asymptote: Update to 2.44.	2018-05-06 00:36:30 +02:00
polkit.scm	…
popt.scm	…
pretty-print.scm	gnu: Move 'astyle' to code.scm.	2018-05-23 12:14:12 +02:00
printers.scm	gnu: robocut: Remove unnecessary dependency on qttools.	2018-05-13 23:16:16 +02:00
profiling.scm	…
protobuf.scm	…
pth.scm	…
pulseaudio.scm	…
pumpio.scm	…
pure.scm	…
pv.scm	…
python-crypto.scm	gnu: Add python-duniterpy.	2018-05-11 11:54:42 +02:00
python-web.scm	gnu: Add python-google-api-client.	2018-05-25 10:36:43 +02:00
python.scm	gnu: Add python-bigfloat.	2018-05-31 18:13:08 +02:00
qt.scm	gnu: qtbase: Fix build on older kernels.	2018-06-01 17:33:25 +02:00
ragel.scm	…
rails.scm	…
ratpoison.scm	…
rdesktop.scm	…
rdf.scm	…
re2c.scm	…
readline.scm	…
regex.scm	…
robotics.scm	…
rrdtool.scm	…
rsync.scm	…
ruby.scm	gnu: ruby-minitest-hooks: Update to 1.4.2.	2018-05-04 01:19:23 +02:00
rush.scm	…
rust.scm	gnu: rust: Add support for building 32-bit packages on 64-bit hosts.	2018-06-01 13:50:27 +02:00
samba.scm	gnu: samba: Update to 4.8.2.	2018-05-26 17:04:18 +02:00
sawfish.scm	…
scanner.scm	…
scheme.scm	…
screen.scm	…
scribus.scm	gnu: scribus: Fix build against Qt 5.11.	2018-05-30 20:45:17 +02:00
scsi.scm	…
sdcc.scm	…
sdl.scm	…
search.scm	gnu: xapian: Use INVOKE.	2018-05-31 04:54:56 +02:00
security-token.scm	gnu: Add yubico-piv-tool.	2018-05-01 22:48:33 -07:00
selinux.scm	…
serialization.scm	gnu: yaml-cpp: Update to 0.6.2.	2018-05-04 02:22:00 +02:00
serveez.scm	…
shells.scm	gnu: dash: Update to 0.5.10.2.	2018-05-19 15:39:25 +02:00
shellutils.scm	…
simh.scm	…
simulation.scm	…
skarnet.scm	gnu: s6-rc: Update to 0.4.0.1.	2018-05-31 04:54:50 +02:00
skribilo.scm	gnu: skribilo: Update to 0.9.4 and switch to Guile 2.2.	2018-04-30 14:22:43 +02:00
slang.scm	…
smalltalk.scm	…
sml.scm	…
speech.scm	…
spice.scm	…
ssh.scm	gnu: liboop: Update to 1.0.1.	2018-05-01 19:29:40 +02:00
sssd.scm	…
stalonetray.scm	…
statistics.scm	gnu: r-minimal: Update to 3.5.0.	2018-06-02 13:39:06 +02:00
storage.scm	…
suckless.scm	gnu: lchat: Mark up description.	2018-05-31 04:54:48 +02:00
swig.scm	Revert "gnu: swig: Patch for Octave 4.4."	2018-05-30 02:18:26 -04:00
sync.scm	…
syncthing.scm	gnu: syncthing: Update to 0.14.47.	2018-05-01 10:52:55 -04:00
syndication.scm	…
synergy.scm	…
task-management.scm	…
tbb.scm	…
tcl.scm	…
telephony.scm	gnu: twinkle: Fix support for codec speex	2018-05-09 20:44:59 -05:00
terminals.scm	gnu: sakura: Update to 3.6.0.	2018-05-31 04:54:58 +02:00
terraform.scm	…
tex.scm	…
texinfo.scm	…
text-editors.scm	gnu: mg: Update to 20180408.	2018-04-26 21:08:58 +02:00
textutils.scm	gnu: utf8proc: Update to 2.1.1.	2018-04-29 03:30:14 +02:00
time.scm	gnu: python-monotonic: Update to 1.5.	2018-05-18 17:40:59 +02:00
tls.scm	gnu: p11-kit: Update to 0.23.11.	2018-05-26 17:04:18 +02:00
tmux.scm	…
tor.scm	gnu: tor: Update to 0.3.3.6 [security fixes].	2018-05-23 15:29:33 +02:00
toys.scm	…
tryton.scm	…
tv.scm	…
uml.scm	…
unrtf.scm	…
upnp.scm	gnu: miniupnpc: Update to 2.1.	2018-05-07 20:16:27 +02:00
uucp.scm	…
valgrind.scm	…
version-control.scm	gnu: Add git-annex.	2018-06-01 13:50:27 +02:00
video.scm	gnu: mkvtoolnix: Use INVOKE.	2018-05-31 04:54:57 +02:00
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